ایشان بهره‌مند گردیده‌اند در درس منظومه آن حکیم الهی شرکت کرده اند.
به علاوه مرحوم استاد مطهری همراه حضرت آیت‌الله منتظری، حاج آقا رضا صدر، حاج شیخ محمد حائری یزدی (فرزند حاج شیخ عبدالکریم حائری) و چند تن دیگر از علما و فضلا، اسفار ملاصدرا را به طور خصوصی نزد امام می‌خواندند. گویا این درس تا سال آخر اقامت آقای مطهری در قم ادامه یافته و سپس تعطیل می‌گردد و حضرت امام خمینی نیز دیگر درس فلسفه نداشتند. مرحوم استاد مطهری این درس و همه درس‌های دیگر را با آیت‌الله منتظری مباحثه می‌کرد.
استاد مطهری که چندسالی نیز به درس خارج اصول حضرت امام خمینی که به درخواست وی و آقای منتظری تأسیس شده بود حاضر شده‌اند. این درس، اولین دوره اصول خارج حضرت امام خمینی بود که غیر از آقای مطهری و منتظری در حدود ده تن دیگر از فضلا در آن شرکت می‌کردند.
این درس در مسجد کوچه حرم واقع در خیابان حرم به طور مرتب یک ساعت و نیم به غروب مانده شروع و در حدود سه ربع ساعت به غروب مانده تمام می‌شد. آنگاه حضرت امام خمینی با همه شاگردان خود به‌طور دسته‌جمعی در مدرسه «فیضیه» یا مسجد «عشق علی»، در درس اصول حضرت آیت‌الله بروجردی شرکت می‌کردند و نهایت تواضع علمی اینجا است که حتی حضرت امام